试管卵泡期长方案和黄体期长方案的区别是取卵的时间不同，卵泡期长方案的时间要更长一点，而且开始的时间也是存在一定的差异的，两种方案并没有谁更好的说法，而是各有各的好处，能满足不同需求，不过对于这两种方案的选择，其实还是会根据个人的身体情况去选择。