湘雅第一、第一、第三医院不仅在湖南，乃至全国也是非常出名的综合性医院，他们都有各自擅长的领域。湘雅附一医院主要针对神经外科、神经内科、耳鼻喉科及产前诊断治疗；湘雅附二医院拥有精神病与精神卫生学、心胸外科、代谢病与内分泌学共三个国家重点学科；湘雅附三是以移植医学和微创医学为主要特色的医院。

综合性来说湘雅附一是这三所中最强的医院，但其他两所也是三甲医院，均排名全国前百，其中附一和附二更是排名前二十。附二院的精神病学科在全国位列前三，附三拥有较新的住院大楼，卫生环境是三所医院中最好的，以下是三所医院对比：

1. 湘雅附一是其中历史最悠久的，无论是科研还是临床都有很深的底蕴。拥有老年医学国家临床医学研究中心、抗癌药物国家地方联合工程实验室、精准分子医学湖南省重点实验室、卫生部肝胆肠研究中心、卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室、耳鼻咽喉重大疾病研究所湖南省重点实验室；

2. 湘雅附二综合性不属于湘雅附一，强势科室主要是精神病、内分泌、皮肤科、心胸外科等。拥有国家精神心理疾病临床医学研究中心、精神疾病诊治技术国家地方联合工程实验室两大国家级平台；

3. 湘雅付三综合性稍逊附一和附二，但也有自己擅长的领域，妇产科的综合实力是三所医院里面最强的，尤其是达芬奇机器人的操作，在全国都是数一数二，另外在卫生条件上也是最好的。