南京第三代试管婴儿成功率高的有江苏省人民医院、南京鼓楼医院、东部战区总医院、南京市妇幼保健院，这些医院的试管婴儿技术好，成功率高。而且这个医院可以做三代试管婴儿，再加上这些医院开展的辅助生殖技术最全面，辅助受孕的成功率在国内也是处于先进水平。