九价疫苗有效期不是一辈子，无论是什么疫苗，注射人体后都有一个时效性，在有效期内能够最大程度的保护人体不受到相关病毒的侵袭，但一旦过了保护期，身体中所含有的相关抗性就会逐渐的消失。由于九价疫苗上市的时间还比较短，还无法准确的确定有效期，但根据研究资料，九价疫苗接种后在人体中产生抗体至少可以存在7年之久，而二价和四价有效期在10年以上，接种10年后，体内抗体阳性率仍达到90%以上。
HPV疫苗发展历程1. 2006年，美国制药公司默沙东研发出全球第一支HPV疫苗，并通过FDA的批准上市，该疫苗为四价疫苗，商品名“佳达修”（Gardasil）；
2. 2007年，英国制药公司葛兰素史克研制成功二价疫苗“希瑞适”（Cervarix），于2009年10月被批准在美国使用；
3. 2014年12月，默沙东公司的九价疫苗佳达修-9（Gardasil-9）上市；
4. 2020年5月，我国国产2价HPV疫苗上市，由厦门万泰沧海生物技术有限公司生产，商品名：馨可宁Cecolin。
至今，全球使用二价、四价疫苗已10年以上，有多项随访研究证实，接种疫苗10年后，体内抗体阳性率仍达到90%以上，科学家按照接种后10年体内的抗体水平推算（只是推算），疫苗的保护时间预计可达50年。接种疫苗后是否终生有效，还有待长期随访来证实，目前已经证实了二价、四价疫苗持续10年以上依然具有保护力。而9价疫苗上市时间相对最短，不过对于9价HPV疫苗随访显示，接种者在接种后的6-7年内未发生过疫苗相关型别的宫颈病变。另外9价HPV疫苗和4价HPV疫苗来自同一药厂，4价HPV疫苗的随访结果一定程度上也从侧面说明了9价HPV疫苗的保护时长。
九价HPV疫苗说明说中表示：目前尚未完全确定本品的保护时限。在研究001的长期扩展研究中，抗体持久性在接种3剂之后长达5年；对高度宫颈病变的保护效力在接种3剂之后长达7.6年（中位数4.4年）。